Разница между внутритекстовыми и подстрочными библиографическими ссылками заключается в их расположении относительно основного текста работы: 12

1. Внутритекстовые ссылки размещаются непосредственно в тексте работы и являются неразрывной частью основного текста. 1 Они помещаются в строке после текста, к которому относятся, и заключаются в круглые скобки. 1
2. Подстрочные ссылки помещаются в нижней части страницы, под основным текстом, от которого отделяются горизонтальной чертой произвольной длины. 1 Они оформляются как примечание и связываются с текстом знаком сноски — соответствующим цифровым номером. 25

Таким образом, внутритекстовые ссылки находятся внутри основного текста, а подстрочные — вынесены из него вниз страницы (в сноску). 12