Разница между «в заключение» и «в заключении» в литературном контексте заключается в их значении и роли в предложении. 1

«В заключение» может быть:

• Производным предлогом. 12 После словосочетания следует существительное в родительном падеже. 1 В этом случае его можно заменить фразой «в завершение». 1 Например: «В заключение лекции преподаватель раздал тест для подготовки к экзамену». 1
• Наречием. 12 Словосочетание не требует дополнительных существительных и имеет значение «в конце». 1 Например: «В заключение диктор рассказал о важности соблюдения введённых ограничений». 1
• Существительным в винительном падеже. 12 Фраза играет роль дополнения в предложении и становится синонимом словосочетания «в тюрьму». 1 Например: «После суда его отправили в заключение в „Полярную Сову“». 1

«В заключении», в свою очередь, имеет два значения: 1

• сходно по значению с выражением «в тюрьме» или «в изоляции». 1 В этом контексте слово «заключение» ставится в творительный падеж и в предложении имеет роль обстоятельства; 1
• обозначает документ, созданный по итогам исследований. 1 Например: «Все его диагнозы указаны в медицинском заключении». 1
• обозначает финальную часть текста, выступления, фильма. 1 В этом случае слово также ставится в творительный падеж. 1 Например: «В заключении книги автор немного рассказал о том, что происходило дальше в жизни главного героя». 1