Разница между «в том числе» и «среди прочего» заключается в их значении и употреблении:

1. «В том числе» — это составной производный союз, который употребляется при присоединении члена предложения, являющегося частью того целого, о котором идёт речь в первой части предложения. 35 Например: «В том числе новобранцев оказался его дед, который уже в начале войны был призывного возраста». 3
2. «Среди прочего» — это словосочетание, которое выступает, как правило, в значении «также» и не требует обособления запятыми. 2 Например: «К его обязанностям относят среди прочего составление расписания». 2

Таким образом, «в том числе» указывает на конкретный элемент, являющийся частью чего-то большего, в то время как «среди прочего» обозначает общий факт, не требующий отдельного перечисления «прочего». 12