Разница между установками пакетов через NuGet Package Manager и с помощью командной строки заключается в том, что каждый из этих способов имеет свои особенности.

NuGet Package Manager — это инструмент, который помогает разработчику управлять сторонними библиотеками (пакетами) в своём проекте. 1 Он позволяет искать, скачивать, устанавливать, настраивать, обновлять и удалять пакеты. 1 Для работы с менеджером нужно в Solution Explorer щёлкнуть правой кнопкой мыши по рабочему проекту и в контекстном меню выбрать пункт «Manage NuGet Packages…». 1

Установка пакетов через командную строку (консоль) осуществляется посредством специальных команд. 1 Управление осуществляется в контексте сохранённого проекта и решения Visual Studio. 5 Например, при установке пакета с помощью команды Install-Package добавляется ссылка на пакет в файле проекта и в обозревателе решений в узле «Ссылки». 5

Таким образом, NuGet Package Manager устанавливает пакет и его зависимости в проект, в то время как установка через командную строку только добавляет пакеты на диск, но не изменяет зависимости проекта. 4