Разница между употреблением вводного слова «понятно» и частицы «понятно» заключается в их значении и роли в предложении:

1. Вводное слово используется для выражения уверенности говорящего в достоверности, истинности, правомерности высказывания в силу ясности для каждого того, о чём в нём говорится. 1 Синонимами служат слова «конечно», «разумеется», «само собой». 1 В этом случае слово выделяется запятыми. 12

2. Частица употребляется с оттенком разговорности в ответной реплике. 1 Она подтверждает осознание и понимание сказанного собеседником или выражает согласие (часто вынужденное) со сказанным. 1 Частица может оформляться как отдельное предложение или обособляться в начале фразы, в этом случае после неё нужны запятые. 12