Разница между суффиксами -ат-, -чат- и -ист- в словообразовании заключается в их значении:

• Суффикс -ат- имеет значение наличия характерного признака или похожести. 1 Примеры: борода — бородАТый, волосы — волосАТый. 1 Если основа исходного существительного заканчивается на К или Ц, то происходит чередование на Ч: губка — губчАТый, клетка — клетчАТый, веснушки — веснушчАТый. 1
• Суффикс -чат- сходен с суффиксом -ат-, но имеет большее количество значений: содержащий в большом количестве, имеющий сходство, способный к действию. 1 Примеры: брус — брусЧАТый, бревно — бревенЧАТый, дым — дымЧАТый. 1 При мотивации названиями веществ, материалов суффикс -чат- выражает значение «сделанный из чего-н.». 3
• Суффикс -ист- используется для образования прилагательных от существительных или глаголов с общим значением обладания чем-либо или склонности к чему-либо. 1 Примеры: пена — пенистый, глина — глинистый. 1 Суффикс -ист- также может выражать значение «содержащий в себе какое-н. вещество, являющийся таким веществом» при мотивации названиями веществ. 3 Примеры: сахаристый, железистый, йодистый. 3

Таким образом, -чат- означает некоторую степень подобия, -ист- — высокую степень качества, а -ат- указывает на наличие характерного признака. 5