В чем разница между стоп-кодонами в иРНК и ДНК?

Возможно, имелись в виду различия между стоп-кодонами, которые распознаёт рибосома и РНК-полимераза.

Для рибосомы в иРНК стоп-кодонами служат три кодона: UGA, UAG и UAA, которые не кодируют аминокислот, а служат знаками окончания трансляции. ru.wikibooks.org ru.wikipedia.org Эти сигналы опознаёт рибосома. ru.wikibooks.org

Для РНК-полимеразы на ДНК есть свои «стоп-сигналы», которые состоят более чем из трёх нуклеотидов. ru.wikibooks.org Для неё стоп-кодоны, которые распознаёт рибосома, не подходят: РНК-полимераза их не воспринимает. ru.wikibooks.org

Таким образом, разница заключается в том, что для разных процессов (распознавания рибосомой и РНК-полимеразой) используются разные стоп-кодоны: для рибосомы — трикодоны, для РНК-полимеразы — последовательность, состоящая из большего количества нуклеотидов. ru.wikibooks.org