Разница между сравнительной анатомией и функциональной морфологией заключается в предмете изучения:

1. Сравнительная анатомия (сравнительная морфология) — биологическая дисциплина, изучающая общие закономерности строения и развития органов и систем органов при помощи их сравнения у животных разных таксонов. 16
2. Функциональная морфология — учение о структурах организма, рассматривающее их в единстве с выполняемой ими функцией. 8

Таким образом, сравнительная анатомия фокусируется на сравнении и сопоставлении органов и их систем у различных видов, в то время как функциональная морфология изучает связь структуры и функции органов, тканей, клеток и их органоидов в отдельном организме. 58