Разница между сравнением двух файлов и двух каталогов в IntelliJ IDEA заключается в том, что первое сравнение работает с отдельными файлами, а второе — с целыми каталогами. 12

Сравнение двух файлов позволяет сравнить содержимое двух файлов построчно. 12 Для этого нужно выбрать оба файла в окне проекта и выполнить одно из действий: щёлкнуть правой кнопкой мыши и выбрать «Compare Files» или нажать комбинацию клавиш Ctrl + D. 12

Сравнение двух каталогов даёт возможность сравнить файлы в двух каталогах по размеру, содержанию или дате создания. 3 В результате сравнения можно увидеть список всех файлов, которые присутствуют в обоих или в одном из каталогов. 2 Также можно определить, какие файлы есть только в одной папке, а какие — в обеих. 2

Таким образом, при сравнении двух файлов сравниваются отдельные файлы, а при сравнении двух каталогов — содержимое целых каталогов.