Разница между союзом «не только, но и» и сложносочинёнными предложениями с другими союзами заключается в их функции и значении:

1. Союз «не только, но и» — это сочинительный соединительный союз, который связывает однородные члены предложения или простые предложения в составе сложносочинённого. 15 По правилу пунктуации запятая ставится перед второй частью союза, то есть словом «но». 1
2. Сложносочинённые предложения с другими союзами, например «и», «но», «а», «или-или», соединяют между собой слова и простые предложения в составе сложносочинённого, где эти простые независимы друг от друга. 4 В таких предложениях могут выражаться временные отношения, действие и его результат, причинно-следственные отношения и другие. 2