В чем разница между союзом и сочетанием «в том числе» в русском языке?

Возможно, имелись в виду различия между функциями сочетания «в том числе» в предложении.

Чаще всего «в том числе» выступает в роли союза, который можно заменить на синоним «а именно». www.kp.ru Его задача — присоединение конструкций, содержащих детальное уточнение, конкретизацию отдельных элементов упомянутой в первой части предложения общности. {7-host}

В редких случаях «в том числе» — это сочетание предлога «в» с указательным местоимением «том». www.kp.ru Тогда «в том числе» выполняет синтаксическую функцию дополнения и отвечает на вопрос «в чём?». www.kp.ru

Таким образом, разница заключается в том, что в большинстве случаев «в том числе» — это союз, а в редких — сочетание, выполняющее разные функции.