В чем разница между системными и прикладными математическими знаниями?

Возможно, имелись в виду различия между системным анализом и прикладной математикой.

Системный анализ — пограничная наука между практическим анализом и математикой. moluch.ru Включает в себя множество базовых понятий и инструментов, которые используются для решения той или иной проблемы. moluch.ru Системный анализ предназначен для решения слабоструктурированных проблем, то есть тех, состав элементов и взаимосвязей которых установлен только частично. moluch.ru

Прикладная математика — наука о том, как математику использовать в различных областях. yandex.ru К областям прикладной математики близки, например, исследование операций и системное программирование. moluch.ru

Таким образом, разница между системными и прикладными математическими знаниями заключается в том, что системные знания ориентированы на решение проблем в сложных ситуациях, а прикладные — на применение математических методов в конкретных областях.