Разница между синтаксисом Markdown и HTML при создании ссылок заключается в следующих особенностях:

• Markdown поддерживает упрощённый порядок автоматического создания ссылок для URL-адресов и адресов электронной почты. 1 Достаточно поместить URL или почтовый адрес в угловые скобки, и Markdown сделает его гиперссылкой. 1
• HTML более выразителен и позволяет достичь некоторых конкретных эффектов, которые могут быть трудны или невозможны в Markdown. 5 Например, с помощью HTML можно указать всплывающую подсказку (title) для ссылки, используя кавычки внутри круглых скобок. 3

Кроме того, синтаксис форматирования Markdown не обрабатывается внутри блочных элементов HTML, в то время как встроенные в документ HTML-элементы не затрагиваются парсером Markdown и попадают в итоговый HTML без изменений. 13