Разница между ро-зависимыми и ро-независимыми терминаторами у прокариот заключается в механизме терминации транскрипции: 12

1. Ро-зависимые терминаторы функционируют посредством особого белка — ро-фактора, который обладает РНК-хеликазной активностью и разрушает комплекс ДНК, мРНК и РНК-полимеразы. 1 Ро-зависимые терминаторы находятся ниже стоп-кодона, на котором завершается трансляция. 1
2. Ро-независимые терминаторы формируют шпильки в структуре синтезирующегося транскрипта, которые при столкновении с РНК-полимеразой вызывают диссоциацию комплекса ДНК, мРНК и РНК-полимеразы. 1