Разница между rather и rather than при построении отрицательных предложений заключается в их значении и употреблении:

• Rather используется как наречие степени, которое означает «довольно», «достаточно» или «в некоторой степени». 3 Например: «Rather good» — довольно хороший, «Rather late» — довольно поздно, «Rather interesting» — достаточно интересный. 3
• Rather than используется в сочетании с rather для сравнения двух действий или предметов. 3 Обычно используется в конструкции «Я бы предпочёл то, а не это». 1 Например: «I’d prefer to go there by bus rather than by train» — Я бы поехал туда на автобусе, а не на поезде. 1

Таким образом, rather указывает на степень или качество действия, а rather than — на предпочтение одного действия другому 235.