Возможно, имелись в виду различия между работой в репозитории и использованием GitHub Wiki.

Работа в репозитории связана с управлением проектами и удалённым сотрудничеством с другими пользователями. 3 В репозитории можно обсуждать текущие проблемы в проектах, делать объявления и предлагать изменения через pull-запросы. 3

GitHub Wiki — инструмент для создания и управления документацией проекта. 1 Он предназначен для улучшения прозрачности проекта, облегчения обмена знаниями и поддержания актуальности документации. 1 С помощью GitHub Wiki можно создавать руководства пользователя, техническую документацию и обзоры проектов. 1

Таким образом, разница заключается в целях использования: репозиторий ориентирован на управление проектами и сотрудничество, а GitHub Wiki — на создание и управление документацией.