Прокариотические клетки имеют меньшее количество генов, чем эукариотические.

Геном прокариотических клеток обычно небольшой (около 1–10 Мб) и имеет высокую плотность генов. 2 Почти во всех случаях в каждой хромосоме прокариотических клеток присутствует по одной копии каждого гена. 5 Лишь немногие гены, например гены рРНК, содержатся в нескольких копиях. 5

Геном эукариотических клеток, напротив, обычно большой (до 100 000 Мб) и содержит больше некодирующих участков, таких как регуляторные последовательности и интроны. 2 В зависимости от вида организмов число линейных двухцепочных молекул ДНК в ядре эукариотических клеток может колебаться от двух до нескольких сотен. 4