Разница между процессингом у прокариот и эукариот заключается в особенностях созревания РНК:

1. У прокариот РНК сразу после синтеза готова к трансляции (биосинтезу белка). 3 Процессы транскрипции и трансляции у них сопряжены: рибосомы могут присоединиться к свободному 5'-концу РНК и начать её трансляцию ещё до завершения транскрипции. 3
2. У эукариот РНК проходит сложное стадийное созревание в ядре. 34 Этот процесс включает присоединение кэп-структуры к 5'-концу молекулы, присоединение нескольких десятков остатков аденина к её 3'-концу (полиаденилирование), выщепление незначащих участков — интронов и соединение друг с другом значащих участков — экзонов (сплайсинг). 4 Только мРНК, успешно прошедшая процессинг, экспортируется из ядра в цитоплазму и вовлекается в трансляцию. 4