Разница между приставками инфра- и суб- при формировании современных научных терминов заключается в их значении:

• Инфра- обозначает «под» и используется в составе слов-терминов, например: инфразвук, инфракрасный, инфраструктура. 13
• Суб- обозначает «расположенный внизу, под чем-либо или около чего-то». 1 В ряде слов также имеет значение «подчиненный, подначальный, не главный, не основной». 1 Примеры: субтропики, субстратосфера, субарктика, субконтинент. 1

Таким образом, инфра- указывает на расположение под чем-либо, а суб- — на подчинённость или расположение внизу чего-либо. 12