Разница между предлогом «в течение» и наречием «впоследствии» заключается в их значении и употреблении:

1. Предлог «в течение» употребляется со словами в форме родительного падежа, обозначающими время: в течение часа, дня, месяца, года. 3 Он выражает временные отношения и отвечает на вопрос «как долго?». 14
2. Наречие «впоследствии» означает «после», «затем», «потом» и обозначает время. 34 Его можно заменить на слово «после чего-то», «затем». 1

Таким образом, предлог «в течение» обозначает отрезок времени, а наречие «впоследствии» — время после какого-то события. 23