С точки зрения фонетики разница между «подытожить» и «подитожить» заключается в том, что согласная «д» в приставке «под-» произносится твёрдо, поэтому буква «и» меняется на «ы». 1

Это объясняется правилом: после приставок, оканчивающихся на согласную букву, пишется гласная «ы». 12 Действует принцип «как слышится, так и пишется». 45