Разница между подчинённым и обычным справочником в 1С заключается в структуре и отношениях между элементами.

Обычный справочник содержит простые списки элементов. 1

Подчинённый справочник имеет владельца, который является элементом или группой другого справочника. 2 При этом элемент подчинённого справочника не может существовать без владельца. 2

Например, справочник «ЕдиницыИзмерения» может быть подчинён справочнику «Товары». 5