Разница между первичной и вторичной группами пользователей в Linux заключается в их назначении:

1. Первичная группа (группа входа в систему) — это группа, которая назначается файлам, создаваемым пользователем. 15 Обычно имя основной группы совпадает с именем пользователя. 1 Каждый пользователь должен принадлежать ровно к одной основной группе. 1
2. Вторичная группа (дополнительная группа) используется для предоставления определённых привилегий пользователям. 15 Пользователь может быть участником не одной или сразу нескольких вторичных групп. 1

Таким образом, основное различие в том, что первичная группа определяет группу, с которой связаны файлы пользователя, а вторичные группы предоставляют дополнительные разрешения и доступ к ресурсам. 2