Разница между apt-get и pip при установке сторонних библиотек заключается в следующем:

• Источник пакетов. 1 apt-get загружает и устанавливает пакеты из репозиториев Ubuntu, а pip — напрямую из PyPI. 1
• Выбор версии пакета. 1 apt-get устанавливает только одну версию пакета (обычно последнюю или выпущенную в ближайшее время), в то время как pip позволяет установить любую версию, загруженную на PyPI. 1
• Установка в виртуальную среду. 13 apt-get устанавливает модули в глобальное расположение, в то время как pip позволяет устанавливать модули только в виртуальную среду проекта. 1
• Скорость установки. 2 apt-get устанавливает предварительно скомпилированные пакеты, что происходит быстрее, чем с pip. 2

Выбор между apt-get и pip зависит от конкретных требований и задач пользователя.