Разница между «отчего» как союзом и предлогом с местоимением заключается в контексте употребления и значении.
Союз «отчего» соединяет две части в сложноподчинённом предложении, выполняет роль союза. 5 По смыслу его можно заменить на «поэтому». 5 Пример: «Темнело быстро, отчего я прибавил шагу». 5
Предлог с местоимением «от чего» указывает на существительное с предлогом «от» в вопросительном предложении. 3 Местоимение «чего» можно заменить другим местоимением или существительным. 4 Пример: «От чего ты хочешь отказаться? От славы, от богатства, от популярности?». 4
Таким образом, союз «отчего» используется для соединения частей предложения, а сочетание «от чего» — для указания на существительное с предлогом «от».