Разница между оптической и электронной микрофотографией заключается в том, что каждая из них использует разные методы для получения изображений мелких объектов. 12

Оптическая микрофотография предполагает использование оптической системы микроскопа для съёмки макроскопических объектов, преимущественно с помощью специальной фотокамеры или возможности установки камеры на микроскоп. 1 Для микроскопов простых конструкций выпускаются микрофотонасадки. 1

Электронная микрофотография применяется для получения фотографий очень мелких объектов, невидимых в оптический микроскоп. 1 Для этого используют электронную микроскопию, которая позволяет увеличить объект более чем в 100 раз. 2

Таким образом, основное различие заключается в том, что оптическая микрофотография ориентирована на съёмку макроскопических объектов, а электронная — на получение изображений очень мелких объектов, невидимых в оптический микроскоп.