Разница между онтологическими моделями и объектно-ориентированным программированием заключается в их назначении и подходе к моделированию:

1. Онтологические модели — это попытка всеобъемлющей и подробной формализации некоторой области знаний с помощью концептуальной схемы. 4 Обычно такая схема состоит из структуры данных, содержащей все релевантные классы объектов, их связи и правила (теоремы, ограничения), принятые в этой области. 4
2. Объектно-ориентированное программирование (ООП) основано на том, что разрабатывая модель приложения, отталкиваются от модели бизнес-области, для создания которой тоже применяют методы ООП. 3 В рамках этого подхода строят онтологическую модель из объектов, обладающих определённым поведением, атрибутами и связями между собой, и взаимодействующих в процессе деятельности. 3