Разница между «не то» и «ни то» в контексте отрицания заключается в том, что каждое из этих словосочетаний используется в разных случаях:

• «Не то» обозначает обычное отрицание, без дополнительного усиления. 1 Например: «Не то утро, а это» или «Не то окно, а другое». 1 Повторяющееся сочетание «не то» также пишется, когда его в высказывании можно заменить на «то ли…то ли». 1 Например: «Не то лужа, не то грязь, не то болото». 1
• «Ни то» применяется в некоторых устойчивых конструкциях, а также при наличии в предложении обычного отрицания с «не», после которого следуют повторяющиеся «ни то». 1 Например: «Настя не увидела ни то дерево, ни то окно, ни тот свет в окне» или «Ни то, ни это Виктора не устраивало». 1

Таким образом, «не то» используется для обозначения отрицания, а «ни то» — для усиления отрицания, когда в предложении уже есть глагол (сказуемое) с отрицательной частицей «не». 12