Разница между наречием «нехотя» и отрицательной частицей «не» заключается в их значении и употреблении:

• «Нехотя» — это наречие, означающее «без желания, неохотно». 24 Оно пишется слитно с «не». 15
• «Не хотя» — это отрицательная частица в сочетании с деепричастием от слова «хотеть». 24 Обычно её можно заменить синонимом «не желая». 4

Таким образом, «нехотя» — это отдельное слово, а «не хотя» — это сочетание отрицательной частицы с деепричастием. 24 Правильность употребления зависит от контекста и требуемой части речи. 4