Возможно, имелись в виду различия между мутуализмом и протокооперацией в контексте взаимоотношений организмов, в том числе микробных сообществ кишечника.

Мутуализм — форма взаимовыгодных отношений, при которой организмы тесно взаимосвязаны, и присутствие партнёра становится обязательным условием существования каждого из них. 12 Например, человек и бактерии кишечной микрофлоры находятся в отношениях мутуализма. 1

Протокооперация — форма взаимовыгодных отношений, при которой организмы могут жить по отдельности, но совместное существование значительно повышает качество жизни. 5 При протокооперации отношения необязательные. 24

Таким образом, разница между мутуализмом и протокооперацией в контексте микробных сообществ кишечника заключается в обязательности взаимодействия: при мутуализме оно обязательное, а при протокооперации — нет. 3