Разница между метаболомикой и метабономикой заключается в том, что первая фокусируется на метаболических профилях на клеточном и органном уровне, а вторая изучает изменения метаболизма, связанные с внешними факторами окружающей среды, патологическими процессами и негенетическими изменениями. 47
Метаболомика занимается каталогизацией и количественным определением низкомолекулярных эндогенных соединений, ксенобиотиков и их метаболитов в биологических жидкостях, органеллах, клетках, тканях, органах или организме. 3
Метабономика изучает изменение метаболического профиля сложных биологических систем в ответ на действие различных физико-химических и биологических факторов. 3
При этом со временем граница между употреблением этих терминов стёрлась, и в настоящее время термин «метаболомика» употребляется для обозначения обоих направлений. 1