Разница между матричными и смысловыми цепями ДНК при биосинтезе белка заключается в их функциях.

Матричная цепь ДНК используется в качестве матрицы для синтеза других цепей, в том числе информационной РНК (иРНК). 12 С матричной цепи ДНК аденин ставится напротив тимина, гуанин — против цитозина, цитозин — против гуанина, а урацил — против аденина. 2

Смысловая цепь ДНК не используется в качестве матрицы. 2 Последовательность нуклеотидов в ней совпадает с последовательностью синтезируемой иРНК, за одним исключением: вместо тимина в иРНК содержится урацил. 12

Таким образом, матричная цепь отвечает за синтез других цепей, а смысловая — за передачу информации о структуре белка.