Разница между «лоскут» и «лоскутья» в современном русском языке заключается в значении этих слов.
Лоскут — существительное мужского рода, которое означает остатки, отходы ткани, кожи и т. п. в текстильном, швейном и кожевенном производствах. 18 Например: «Лоскут материи», «лоскут бумаги». 4
Лоскутья — существительное во множественном числе, которое означает лохмотья, обрывки, клочья, более мелкие остатки. 34 Например: «Лоскутья одежды», «лоскутья скатерти». 4
Таким образом, лоскут больше по значению, чем лоскутья: лоскут — о крупных отрезках, лоскутья — о мелких.