Разница между корневыми и аффиксальными безударными гласными в русском языке заключается в том, что для их правописания применяются разные правила. 2

Корневые безударные гласные — это неударяемые гласные в корне слова, написание которых проверяется подбором родственных слов или изменением грамматической формы. 57 Например, корневые гласные «а», «о», «и», «е», «я». 1

Аффиксальные безударные гласные — это гласные в других частях слова, например, в приставке, суффиксе, окончании. 26 Например, чтобы проверить безударную гласную в приставке, можно подобрать слово с ударной приставкой: оттиснуть — оттиск, надписать — надпись. 2 Чтобы проверить безударную гласную в суффиксе, нужно подобрать слово с аналогичным ударным суффиксом: умник (ученик), говядина (осетрина). 4

Таким образом, для правописания безударных гласных в разных частях слова применяются разные правила.