Разница между корнем и основой слова при морфологическом анализе заключается в следующем:

• Корень — это главная значимая часть слова, носитель его лексического значения. 1 Как правило, регулярно повторяется в однокоренных словах. 1
• Основа — это часть слова без окончания и формообразующих суффиксов. 1 Может включать в себя и другие части слова: приставку и суффикс. 4 Основа всегда уникальна в слове. 1

Таким образом, корень — это наименьшая значимая часть слова, а основа — это всё слово, кроме окончания, и может содержать в себе приставку, корень и суффикс. 12

При этом основа слова может совпадать с его корнем, если слово состоит только из одного корня или из корня и окончания (нет приставки и суффикса). 1