Разница между корнем и основой слова заключается в их определении и роли:

1. Корень — главная значимая часть слова, в которой заключено общее лексическое значение однокоренных слов. 1 Вокруг корня группируются все остальные значимые части: приставка, суффикс, окончание. 1
2. Основа — это часть слова, которая остаётся, если отделить от неё окончание и формообразующую морфему, и с которой связывается лексическое значение этого слова. 2 В неё входят все части слова, кроме формообразующих суффиксов. 3

Таким образом, корень регулярно повторяется в однокоренных словах, а основа в слове всегда уникальна. 2 Меняется основа — меняется слово. 2

При этом основа слова может совпадать с его корнем, если слово состоит только из одного корня или из корня и окончания (нет приставки и суффикса). 4