Разница между изумрудом и аквамарином с точки зрения химической структуры заключается в примесях, определяющих цвет минералов. 1

Изумруд имеет химическую формулу Al2Be3(Si6O18) — это комбинация атомов бериллия, алюминия, кремния и кислорода. 5 Зелёный цвет минералу придают примеси ванадия или хрома (чаще первого). 1

Аквамарин имеет химический состав Be3Al2Si6O18, также содержащий Fe2+. 3 Голубой цвет камню придаёт железо. 1

Таким образом, основная химическая формула у изумруда и аквамарина идентична, но различные химические элементы позволяют им иметь свой цвет: хром, который содержит изумруд, делает его зелёным, а железо, содержащееся в аквамарине, превращает его в голубой. 7