Разница между #include и #pragma once при работе с заголовочными файлами заключается в их назначении:

1. Директива #include вставляет код из указанного файла в текущий файл, позволяя использовать его функции, классы, переменные. 1
2. Директива #pragma once указывает компилятору, что файл нужно подключить только один раз, предотвращая «двойное подключение» заголовочных файлов и ошибки при компиляции. 34

Таким образом, основное различие в том, что #include позволяет подключать заголовочные файлы, а #pragma once — защищать их от повторного включения.

Выбор между этими директивами зависит от конкретных требований проекта.