Разница между G-окрашиванием и Q-окрашиванием хромосом заключается в используемых методах и получаемом рисунке:

1. G-окрашивание базируется на предварительной обработке препаратов хромосом перед окраской и на использовании нефлюоресцентных красителей или их смесей типа Романовского–Гимзы. 1 Идентификацию хромосом обеспечивает чередование тёмно- и светлоокрашенных полос. 1 Этот способ окрашивания позволяет идентифицировать хромосомы, выявлять делеции, инверсии, инсерции, транслокации, ломкие участки и более сложные перестройки. 1
2. Q-окрашивание предполагает обработку хромосом различными флюорохромами и анализ с помощью флюоресцентной микроскопии. 1 Рисунок каждой хромосомы специфичен по числу, положению и размеру полос по-разному светящихся сегментов, что обеспечивает идентификацию всех хромосом. 1 Чаще всего применяется для исследования Y-хромосом (быстрое определение генетического пола, выявление транслокаций между X- и Y-хромосомами или между Y-хромосомой и аутосомами, скрининг мозаицизма с участием Y-хромосом). 5