Разница между гликопротеинами и протеогликанами заключается в доле углеводного компонента: у гликопротеинов она малая, у протеогликанов — большая. 4

Гликопротеины включают 10–20% углеводов и 80–90% белков. 1 Они не содержат уроновых кислот, их углеводные цепи короткие. 4

Протеогликаны состоят из белка (5–10%) и гликозаминогликанов (90–95%). 1 На долю углеводов приходится 80–85%. 4 Протеогликаны отличаются наличием уроновых кислот, длинными углеводными цепями. 4