Разница между фитогеографией и зоогеографией как научными дисциплинами заключается в объекте изучения:

• Фитогеография — наука, изучающая закономерности распространения растений по поверхности Земли. 12 Она исследует распределение видов и других таксонов по земному шару, а также факторы, определяющие состав целых сообществ и флор. 2
• Зоогеография — раздел биогеографии, наука, изучающая распространение животных на планете Земля. 68 Она устанавливает общие закономерности и условия распространения животных, исследует распределение фаунистических комплексов, а также процессы расселения и вымирания животных, то есть процессы расширения и сокращения их ареалов. 6

Таким образом, фитогеография фокусируется на растениях, а зоогеография — на животных.