Разница между филогенезом и онтогенезом заключается в следующих аспектах:

• Определение понятий. 1 Онтогенез — это индивидуальное развитие организма, а филогенез — историческое развитие группы организмов. 1

• Сроки протекания процессов. 5 Онтогенез протекает в сжатые сроки (часы, месяцы, годы), существует начало и окончание. 5 Филогенез протекает в исторически длительные сроки (многие тысячи и миллионы лет), принципиально не ограничен. 5

• Генетическая программа развития. 5 В онтогенезе присутствует уникальная неизменная генетическая программа развития, сформированная вследствие мейоза и оплодотворения. 5 В филогенезе генофонд эволюционирующей группы непрерывно изменяется. 5

Эти процессы тесно связаны между собой: с точки зрения эволюционной теории, историческое развитие живой природы представляет собой череду онтогенезов. 1