Разница между естественным и искусственным мутагенезом заключается в причинах возникновения мутаций:

1. Естественный (спонтанный) мутагенез происходит вследствие воздействия на генетический материал живых организмов мутагенных факторов окружающей среды, таких как ультрафиолет, радиация, химические мутагены. 1 Причиной природного мутагенеза могут быть также физиологические и биохимические изменения в организме. 4
2. Искусственный (индуцированный) мутагенез — это метод, используемый в генетике и селекции, способствующий созданию и изучению новых мутаций в геноме организма. 6 В основе метода лежит создание искусственных изменений в генотипе (мутаций) с целью изменения фенотипических (внешних) характеристик организма. 6 Для искусственного путём вызвать мутации применяют химическое воздействие, ионизирующее излучение, высокие температуры, электрический ток и другие факторы воздействия. 6