Разница между эоном и эрой заключается в их значении и использовании:

1. Эон (в переводе с греч. — «век, эпоха») в геологии — отрезок времени геологической истории Земли, длительный этап развития литосферы и биосферы Земли, в течение которого формировалась эонотема. 7 Эон объединяет несколько геологических эр, в международной шкале геологического времени, принятой в 1991 году, это — наиболее крупное подразделение. 7
2. Эра (от лат. aera, букв. — исходное число) в геологии — крупное подразделение геохронологической шкалы, отвечающее длительному этапу развития литосферы и органического мира Земли. 1 Является частью геологического эона и соответствует интервалу геологического времени, в течение которого накопились слои горных пород, составляющие эратему. 1