Разница между доминантными и кодоминантными генетическими маркерами заключается в их способности отличать гетеро- и гомозиготы друг от друга. 1

Доминантные маркеры не позволяют этого делать, так как выявляют только один аллель. 15 Как правило, доминантные маркеры проявляют различия в наличии или отсутствии электрофоретических полос. 1

Кодоминантные маркеры позволяют различать гомо- и гетерозиготы, так как их гетерозиготное состояние отличается от гомозиготного. 2 Как правило, кодоминантные маркеры проявляют различия в размере электрофоретических полос. 1

Таким образом, точность оценок при помощи кодоминантных маркеров выше, так как их гетерозиготное состояние отличается от гомозиготного, в отличие от доминантных маркеров. 2