Чистая линия и штамм — это разные понятия, но штамм является аналогом чистой линии у микроорганизмов. ru.ruwiki.ru ru.wikipedia.org
Чистая линия — группа организмов, имеющих некоторые признаки, которые полностью передаются потомству в силу генетической однородности всех особей. ru.ruwiki.ru Все организмы, относящиеся к одной чистой линии, являются гомозиготными по одному и тому же аллелю данного гена. videouroki.net ru.ruwiki.ru
Штамм — это искусственно созданная устойчивая группа (популяция) живых организмов, имеющая определённые наследственные особенности. www.yaklass.ru Все особи такой группы имеют сходные морфологические и физиологические признаки, однотипную реакцию на изменение факторов внешней среды, определённый уровень продуктивности. www.yaklass.ru
Таким образом, разница заключается в том, что чистая линия относится к высшим организмам, а штамм — к микроорганизмам.