Разница между центромерами гомологичных и негомологичных хромосом заключается в их структуре и происхождении.

Гомологичные хромосомы относятся к одной паре, одинаковы по размерам, форме, составу и порядку расположения генов, но различны по происхождению (одна унаследована от отцовского, другая — от материнского организма). 1 Центромеры таких хромосом также одинаковы по величине, форме и расположению. 1

Негомологичные хромосомы не образуют пары и различаются по своим генетическим характеристикам. 5 Они всегда имеют ряд отличий. 1

Таким образом, центромеры гомологичных хромосом идентичны, а центромеры негомологичных хромосом отличаются.