Разница между архаллаксисом и девиацией в эволюционной биологии заключается в том, на каком этапе развития происходят изменения. 18
Архаллаксис — эволюционное изменение начальных стадий формообразовательных процессов или изменения самих зачатков органов. 8 При этом наблюдается коренная перестройка в развитии органа, отклонение в развитии предков и потомков с самого начала. 8 Пример архаллаксиса — развитие волос у млекопитающих, закладка которых наступает на очень ранних стадиях развития и с самого начала отличается от закладок других придатков кожи позвоночных. 25
Девиация — эволюционное изменение в развитии органа на средних стадиях его формирования. 110 При девиации ранние предковые стадии повторяются, а более поздние заменяются развитием в новом направлении. 2 Пример девиации — развитие сердца у млекопитающих, у которых оно рекапитулирует стадию трубки, двухкамерное и трёхкамерное строение, но стадия формирования неполной перегородки, характерной для пресмыкающихся, вытесняется развитием перегородки, построенной и расположенной иначе и характерной только для млекопитающих. 2
Таким образом, архаллаксис происходит на ранних стадиях развития, а девиация — на средних.