Разница между алгологией и альгологией заключается в предметах изучения и сферах применения этих понятий.

Алгология — область медицины, изучающая острую и хроническую боль, её патофизиологию, методы борьбы с болью, противоболевую терапию и обезболивающие средства. 25 Задача алгологии — не устранить боль вообще, а помочь человеку справиться с определёнными типами боли. 37

Альгология — раздел биологии, изучающий водоросли. 48 Альгология исследует морфологию, анатомию, биохимию, физиологию, генетику, экологию и географическое распространение водорослей. 14

Таким образом, алгология связана с медициной и болью, а альгология — с биологией и водорослями.