Различия между сероварами и фаговарами бактерий заключаются в признаках, по которым классифицируют микроорганизмы.

Серовар (серотип, серовариант) — группа бактерий одного вида, которые объединяются общей антигенной структурой. 25 Систематизация ведётся на основе вирулентности, липополисахаридов, грамотрицательности, присутствия экзотоксинов, генетических особенностей или других факторов, позволяющих различить двух особей одного вида. 25 Серовар не является таксономической категорией и позволяет систематизовать патогенные и условно-патогенные микроорганизмы. 25

Фаговар (фаготип) — внутривидовая систематическая категория, разновидность штамма микроорганизмов, которая отличается от других вариантов этого же вида по спектру чувствительности к типовым фагам. 6 Часто используется для характеристики патогенных микроорганизмов. 6

Таким образом, серовары классифицируют бактерии по антигенной структуре, а фаговары — по чувствительности к фагам.